通常ルート（全てを授けし者）と、零からの旅人（トゥルーエンド）ルートの両方クリア後に裏ボスと戦うことが出来る。
創雲の間：祖龍アマツカミノオロチ戦
両ルートクリア後のデータをロードすると、虚栄の輝空に入って正面のところに光が追加されている。
この光を調べると創雲の間に入ることができる。
創雲の間は敵が出現せず、入ってすぐにセーブポイントと宝箱がある。
宝箱：浮遊石
セーブポイント近くの坂を上っていくとある光の球体にふれるとイベント、祖龍アマツガミノオロチ戦
・祖龍アマツカミノオロチ
HP120万
シールド29→31
弱点：剣本氷光
盗：超回復のジャム
ドロップ：竜の火炎の極意（消費SP30,敵全体に火大ダメージ）
・竜紅玉
HP12万
シールド15
弱点：剣本氷光
・竜黄玉
HP80000
シールド8
弱点：斧杖風闇
・竜翠玉
HP11万
シールド13
弱点：短剣弓雷光
祖龍アマツカミノオロチはHP120万と非常に高く、敵の攻撃も激しいため、ナッツによる強化をしてから挑んだほうがよい。
祖龍アマツカミノオロチは、弱点を突いた際に弱点が変化することがある。
剣本氷光→槍扇火闇→斧杖風闇→短剣弓雷光→…
アマツカミノオロチはBPが最大になると「無地無天・序」が発動し、全体に9999ダメージ食らって全滅してしまうのでその前にブレイクしてBPを解除する必要がある。
玉が邪魔だがアマツカミノオロチをブレイクすれば引っ込むので無視しても問題ない。
撃破後イベント、創雲の宝玉を貰える。
また、トロフィー「竜を超えし者」を獲得できる。
PT構成例：短期決戦
| 前列 | 後列 |
|---|---|
| リシャール | レイメ |
| サイラス | オルベリク |
| シアーシャ | セルク |
| 主人公 | 誰でも可 |
前列のキャラとセルクは、その他装備でHPを高めておきたい。ナッツで強化でも可。
シアーシャとリシャールは早めに行動できるようにし、逆にサイラス主人公は遅めになるように、速度も調整しておきたい。
主人公
バトル：どしゃぶり矢の極意
サポート：ラストアクト/回復限界突破
HP/命中をナッツで強化
開幕シアーシャに必殺技「律動のアリア」Lv2を使ってもらい、弱点に関係なく弱点を突けるようにし、ヒット数の多いどしゃぶり矢でシールドを削る。
主人公だけでもかなりのシールドを削ることができ、大体3ターン目くらいにはブレイクでき、ブレイク中の4ターン目にオルベリク＆レイメで一気にダメージを与えて倒しきれる。
サイラス
バトル：特大暗闇魔法
サポート：ラストアクト/回復限界突破
HP/属攻をナッツで強化
各種全体魔法で弱点を突いてシールドを削る。
サイラスは火氷雷の大魔法を持っているので、セレクトアビリティで特大暗闇魔法をつければ上記アマツカミノオロチのどの弱点パターンでも弱点を突ける形になる。
大魔法は2ヒット、特大魔法は3ヒットと比較的少ないが、復習で2回発動してくれることもある。
ブレイクしたらオルベリクと交代
シアーシャ
サポート：いきなり必殺技チャージ/回復限界突破
主人公より先に行動するように速度に注意。
いきなり必殺技チャージで開幕に必殺技「律動のアリア」Lv2を発動できるようにし、狩人の主人公にかける。
主人公に必殺技を使ったらセルクと交代。
リシャール
バトル：大回復
サポート：いきなり必殺技チャージ/回復限界突破
いきなり必殺技チャージで開幕に必殺技「陣頭指揮・奮迅」Lv2を発動できるようにし、味方全体を強化する。
強化した後は、大回復で回復し前衛が倒れないようにする。
ブレイクしたらレイメと交代
セルク
バトル：特大光明魔法/特大火炎魔法
サポート：ラストアクト/回復限界突破
HP/属攻をナッツで強化
サイラスと同様に各種全体魔法で弱点を突いてシールドを削る。
セルクは氷風の大魔法を持っているので、セレクトアビリティで特大光明魔法と特大火炎魔法をつければアマツカミノオロチのどの弱点パターンでも弱点を突ける。
ブレイク中やることがないため、3ターン目に早めにブレイクした際にオルベリクが攻撃できるようならブーストMAXで攻撃させて、セルクでBP回復アイテムを使って4ターン目にもオルベリクがブースト最大で攻撃できるようにするとよい。
オルベリク
武器：歴戦の剣/歴戦の槍
その他：一気呵成の爪/進化の重牙
バトル：千本槍
サポート：極限の力/ブースト強化
HP/SP/物攻/命中をナッツで強化
物攻は999まで上げた。
ブレイク時に前列に出てブーストMAX千本槍で大ダメージを狙う。
物防ダウン2段階のデバフ、物攻アップ2段階のバフが入った状態でブレイク時ならクリティカルで99999×5～10出るため、一気に削ることができる。
3ターン目のサイラス行動前にブレイクできていれば1度のブレイク中に2度オルベリクで攻撃できるので（ほかキャラでBPを回復して貰う必要あり）、千本槍のヒット数が低めだった場合でも恐らく1度のブレイク中に倒しきれると思われる。
レイメ
武器：聖剣フィステラルダ/風雲の槍
サポート：極限の力/ダメージ限界突破
物攻999までナッツで強化
オルベリクと同様にブレイク時に前列にでて必殺技で大ダメージを狙う。
物防ダウン2段階のデバフ、物攻アップ2段階のバフが入った状態でブレイク時なら6～7万前後×6出るので、オルベリクの攻撃やシールド削り中の攻撃も合わせて倒しきれる。
その他
デバフは支援者を使う。
アトラスダムにいる「目つきの悪い金貸し」が敵単体に物防/属防ダウンできるため、ターン一番始めに行動するキャラに1ターン目と2ターン目に支援者「目つきの悪い金貸し」を使わせれば、物防/属防ダウン2段階付与できる。
不思議な家（開発室）イベント
創雲の宝玉を入手後、
ウィッシュベールに施設「不思議な家」を設置し、アイラを移住させる。
創雲の宝玉を所持した状態で、アイラがいる不思議な家に入るとイベント。
不思議な家の中に謎の光が出現するので調べると「零の酒場」に行ける。
いわゆる開発室と呼ばれるお遊び要素？
零の酒場右側にある光るポイントを調べると「強敵戦闘曲の楽譜Ⅰ」が入手できる
零の酒場の舞台上にある光るポイントを調べると「シャットアウトリボン（敵と遭遇しなくなる）」を入手できる。
舞台上にいるデラン=ボーからねだるで「記されざる島の楽譜」が入手できる。
舞台上にいるルキズ=スッラから勝ち取るLv65で「闘技場の楽譜Ⅱ」を入手できる（キングオクトリンとブルジョワキャットリンも一緒に出現する）
舞台上にいるミャーノ=ウィンシーから買取るで「創生の楽譜」を入手できる。
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